Липопротеиновая транспортная система выполняет две основные функции: осуществляет эффективный транспорт ТГ из кишечника и печени к местам их утилизации (жировая ткань и мышцы), транспорт ХС в периферические ткани для построения мембран и выработки стероидных гормонов и в печень для синтеза желчных кислот.

Для поддержания жизни необходимы жиры. Человеческий организм извлекает из пищи незаменимые жирные кислоты (ЖК), которые он не может производить. Жир составляет от 20 до 40% ежедневно потребляемых калорий, а триглицериды (ТГ) составляют основной объем перевариваемых жиров. При потреблении 2000 ккал/сут, в которых 30% — жиры, триглицериды (ТГ) составляют 66 г и ХС 250 мг (0,250 г). При пищеварении липазы поджелудочной железы гидролизуют ТГ до СЖК и моноглицеридов или диглицеридов. Эмульсификация желчными кислотами ведет к образованию кишечных мицелл. Мицеллы сходны с липопротеинами тем, что также состоят из ФЛ, свободного ХС, желчных кислот, диглицеридов, моноглицеридов, СЖК и глицерина. Изучение механизма захвата мицелл щеточной каймой клеток кишечника продолжается.

Белок 1, подобный белку Niemann-Pick Cl (Niemann-Pick C1-like protein 1, NPC1L1), является частью кишечного комплекса транспортеров холестерина (ХС) и служит мишенью ингибитора селективного всасывания холестерина (ХС) эзетимиба. Разработанные ингибиторы всасывания холестерина (ХС) вновь пробудили интерес к изучению механизма всасывания жиров в кишечнике. После проникновения в клетки кишечника ЖК подвергаются реэстерификации с формированием ТГ, их упаковыванием в ХМ внутри клетки кишечника и проникновением в портальный кровоток.

Хиломикроны (ХМ) содержат апо Н48, аминоконцевой компонент апо В100. В кишечнике геи апо В во время транскрипции модифицируется в матричную рибонуклеиновую кислоту с заменой урацила на цитозин ферментным комплексом АроВес, ответственным за образование апо В48. Этот механизм предполагает участие дезаминазы цитозина, что ведет к образованию терминирующего кодона на остатке 2153 и созданию укороченной формы апо В. АроВес экспрессируется только клетками кишечника. После приема пищи хиломикроны (ХМ) быстро проникают в плазму крови. В капиллярах жировой или мышечной ткани периферического кровообращения ХМ подвергаются действию липопротеиновой липазы (ЛПЛ) — фермента, который прикреплен к гепарансульфату и находится на обращенной к просвету сосуда поверхности эндотелиальных клеток. Активность липопротеиновой липазы (ЛПЛ) модифицируется посредством апо СИ (активатор) и апо CIII (ингибитор).

Липопротеиная липаза (ЛПЛ) обладает широкой специфичностью к ТГ и гидролизует все жирнокислотные остатки, присоединенные к глицерину, образуя три молекулы СЖК на каждую молекулу глицерина. Мышечные клетки быстро захватывают жирные кислоты (ЖК). Жировые клетки могут хранить триглицериды (ТГ), образовавшиеся из ЖК, для утилизации энергии; для этого необходим инсулин. Жирные кислоты (ЖК) также могут соединяться с белками, связывающими ЖК, и транспортироваться в печень, где они вновь включаются в состав липопротеинов очень низкой плотности (ЛОНП). Резистентность к инсулину периферических тканей может приводить к усиленной доставке СЖК к печени с последующим увеличением секреции ЛОНП и ростом в плазме крови частиц, содержащих апо В, что является одним из последствий метаболического синдрома (МС). Ремнантные частицы, образующиеся из хиломикронов (ХМ) в результате действия ЛПЛ, содержат апо Е и проникают в печень с последующей деградацией и реутилизацией их ядерных компонентов.